Esta pizza lleva el nombre de la reina Margarita de Saboya, esposa del rey Humberto I.
Cuenta la historia en en 1889 esta pareja real había ido de vacaciones al palacio de Capodimonte en Nápoles y la reina pidió conocer la famosa pizza napolitana de Don Rafael Espósito, quien era el dueño de la pizzería.
Fue así que contrató los servicios de este pizzaiolo ( se llama así al que elabora la pizza , quién era el más famoso de la época para probar esta especialidad napolitana.
Así fue que que el pizzero y su esposa Rosa fueron al palacio de verano para elaborar las pizzas.
Le prepararon tres variedades. Una a la albahaca, otra con ajo, aceite y tomate y la tercera con albahaca, tomate y mozzarella, ésta última con los colores de la bandera italiana. Bianco, rosso e verde ( blanco, rojo y verde ).
La reina quedó facinada al probar esta última y esto fue aprovechado por el fueño de la pizzería quien la bautizó como «Pizza Margarita«.